三、室内污染物的排出
一般来说，模块化洁净室室内气流以内循环形式流动。合理的气流组织，即通过送风口与回风口位置、大小、形式的精心设计，使车间内气流沿一定方向流动，防止死角及造成二次污染。不同的气流组织形式对于施工的难易程度也不同。百级以上高洁净度的洁净室均采用单向流形式，室内换气速度快，但造价也高。而洁净度级别为千级、万级、十万级的洁净模块化洁净室则采用非单向流的气流组织。
四、气流流速的控制
模块化洁净室内空气的流动要有一定速度，才能避免其他因素的干扰。但又不能太大，流速太大将使室内积尘飞扬，造成污染。要保证空调房间气流组织的合理性。气流组织如果被破坏，不但室内的温度分布受影响，而且因为蜗流过多，使墙角、地面附近的不洁气流扩散到室内工作区。因此，空调房间内的工作台，设备的布置要考虑到气流组织的合理性。设备不能把回风口挡住，回风口百叶严禁乱动。
五、系统的气密性
要保证空调房间气流组织的合理性。气流组织如果被破坏，不但室内的温度分布受影响，而且因为蜗流过多，使墙角、地面附近的不洁气流扩散到室内工作区。因此，空调房间内的工作台，设备的布置要考虑到气流组织的合理性。设备不能把回风口挡住，回风口百叶严禁乱动。
六、建筑上的措施
涉及建筑物周围环境的设计、建筑构造、材料选择、平面布局、气密性措施等设计。例如，采用产尘少、不易滋生微生物的室内装修材料。
