模块化洁净室的设计和施工并不像想象的那么简单，它是一个大工程，需要消耗大量的能源，尤其是空调。因此，在设计和施工中，一定要注意节能措施、系统和面积划分、做好风量计算、明确温湿度需求。为了保证模块化洁净室的全过程调节，应根据需求及气候等条件选配自动控制的空调配置。此外，空调房应设计在模块化洁净室中，不仅可以节约能源，还能使气流更加合理。
模块化洁净室的设计中应注意的问题
1、模块化洁净室空气设计系统
模块化洁净室空气净化系统的气流分布大致分为水平层流、垂直层流和乱流。气流方式按常规选择，洁净度主要由单位时间换风次数决定。因此，在确定净化系统的技术参数之前，需认真考虑模块化洁净室内的生产需求与行业性质。
2、模块化洁净室方案设计
在决定模块化洁净室的设计之前，需仔细考虑所安装的车间的行业性质和气流条件。在粉尘排放量较大的洁净室内，不要使用地面送风，以免进入其他需要清洁的工作场所。
3、压力和气流
模块化洁净室需防止外界空气进入室内，室内必须保持正压才能达到目的。为了获得必要的室内压力，需添加适当的新鲜空气。
4、人、物防尘
人和物体是粉尘的主要来源，应加以控制。比如进入模块化洁净室前，每个人都需换洁净无尘衣、鞋、帽，做好消毒清洁，并相应通过风淋室、货淋室吹淋进入，以减少尘源污染。
5、排水、供气、供电
在模块化洁净室的设计过程中，根据项室内实际情况和客户的具体要求，做好以上几点。按设计方案运行的洁净室应提供所需的给排水装置、供气装置和电源。这些装置和相关设备的设计需易于使用，并且不会对空气净化系统造成障碍。
