食品洁净室（洁净车间）微生物检测是食品安全管理的重要环节，它能够确保食品在生产、加工和包装过程中不受微生物的污染，从而保障消费者的健康。这些检测项目不仅有助于企业控制产品质量，还符合对食品安全的严格要求。食品洁净室微生物检测项目一般有浮游菌、沉降菌以及表面微生物。
首先，浮游菌测试方法是通过使用特定的采样设备，如浮游菌采样器，收集空气中的微生物颗粒。这些采样器通常包含一个营养培养基，用于捕获并培养浮游菌。在设定的流量和时间内，采样器会吸入一定量的空气，然后对培养基进行培养，以使捕获的微生物生长形成菌落。根据培养结果，可以评估洁净室中的浮游菌浓度，从而判断环境的微生物污染水平。食品洁净室根据不同的等级，对空气中浮游菌的数量分别有静态、动态不同规定。
其次，沉降菌测试方法是通过自然沉降原理，将洁净空气中的存活微生物收集在培养基平皿中，并在适宜的条件下培养至可见的菌落进行计数，以此来评定洁净室（区）的洁净度。同样，食品洁净室根据不同的等级，对空气中沉降菌的数量分别有静态、动态不同规定。
此外，食品洁净室还对表面微生物进行检测，包括接触皿（与食品接触表面、建筑内表面），以及5指手套。要求与食品接触表面不得检出沙门氏菌和金黄色葡萄球菌。建筑内表面不得有霉菌班。
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